המושג "מיקרוביום" מתאר את כל היצורים החיים המיקרוסקופיים (מיקרואורגניזמים) שקיימים בגופנו ומקיימים איתו יחסי גומלין. המיקרוביום כולל בעיקר חיידקים, אבל גם ארכיאה, וירוסים (נגיפים), פטריות חד תאיות וגם יצורים חד תאיים נוספים כמו אמבות, פרוטוזואות ועוד.
כדאי לדעת: איך מסווגים את היצורים החיים?
כדי שנבין מי כלול במיקרוביום, חשוב להבין איך ממיינים את כל היצורים החיים. מדע מיון היצורים החיים לקבוצות לפי מאפיינים משותפים נקרא טקסונומיה. ממיינים את היצורים כך שקבוצות בעלות מכנה משותף שייכות לקבוצת על ברמה גבוהה יותר. בטקסונומיה של חיידקים משתמשים במיון לרמות בסדר עולה: מרמת הזן, שזו הרמה הכי ספציפית, למינים, סוגים, משפחות, סדרות, מחלקות, מערכות ולבסוף - לממלכה.
כך למשל, אפשר להבין שכשאומרים "אי. קולי" מדובר במין של חיידק, שיש לו הרבה זנים, ולכל זן יש מאפיינים ותפקידים משלו במיקרוביום שלנו, כך שחשוב לדעת גם את המין של החיידק וגם את הזן שלו. כשאנחנו מבצעים את הריצוף הגנטי של המיקרוביום שלכם, אנחנו מזהים את החיידקים עד רמת הזן, הרזולוציה הגבוהה ביותר.
קבוצות של זנים שייכות לאותו מין, קבוצות של מינים נחשבות יחד כסוג, קבוצות של סוגים שייכות יחד לאותה משפחה, קבוצות של משפחות שייכות לאותה סדרה, סדרות שייכות לאותה מחלקה, מחלקות שייכות לאותה מערכה ומערכות שייכות לאותה ממלכה.
בטבלה שלפניכם תוכלו לראות דוגמה לטקסונומיה של חיידק ספציפי לעומת אדם.
בן אדם (הומו סאפיאנס) |
החיידק Faecalibacterium prausnitzii |
|
ממלכה |
בעלי חיים |
חיידקים Bacteria |
מערכה |
מיתרניים |
פירמיקוטים Firmicutes |
מחלקה |
יונקים |
קלוסטרידיה Clostridia |
סדרה |
פרימאטים |
Clostridiales |
משפחה |
הומנואידים |
Clostridiaceae |
סוג |
הומו |
Faecalibacterium |
מין |
ה. סאפיאנס |
F. prausnitzii |
זן |
|
gcf000154385 |
הערות
המאמר סגור להערות.